Geber86 / Getty Images
Võtmed kaasa
- Los Angelese lastehaigla viis läbi seni suurima laste genoomse uuringu COVID-19.
- Uuringus esitatakse võimalik seos teatud SARS-CoV-2 mutatsioonide ja haiguse raskuse vahel.
- Proovid näitasid Californias kõrgeid geneetilisi variatsioone.
Nagu paljud viirused, nii ka COVID-19 põhjustav viirus SARS-CoV-2 läbib arvukalt geneetilisi mutatsioone, kuna see levib suurel populatsioonil. Teadlased on alles hakanud mõistma neid variatsioone ja nende mõju tervisele, eriti laste puhul.
Senises suurimas pediaatrilises genoomilises uuringus COVID-19 leidis Los Angelese lastehaigla meeskond seose viirusmutatsioonide ja haiguse tõsiduse vahel. Novembrikuu uuring avaldati ajakirjasAvatud foorum nakkushaigused.
"Kui me saame midagi teha, et teada saada, kas viirusgenoomi mutatsiooni geneetika ja haiguse fenotüübi (COVID-19 jälgitavad omadused) vahel on mingi seos, võite olla kursis patsiendi ravimise viisidega," Xiaowu Gai , PhD, uuringu üks autoritest ja Los Angelese lastehaigla bioinformaatika direktor, ütleb Verywellile.
Püüdes paremini mõista, kuidas geneetiline varieerumine võib mõjutada laste populatsiooni, analüüsis uurimisrühm ajavahemikus 13. märtsist kuni 16. juunini 141 nakatunud lapse viiruse geneetilist teavet. Need proovid näitasid suurt variatsiooni ja levinud levimus mutatsioon, mis on seotud suurema ülekandekiirusega.
Mida see teie jaoks tähendab
COVID-19 põhjustava viiruse SARS-CoV-2 geneetiline materjal areneb pidevalt. Teadlased töötavad selle nimel, et mõista, kuidas geneetilised mutatsioonid võivad mõjutada viiruse edasikandumist ja nakatunud patsientide haiguse raskust.
Üha muutuv viirus
Mutatsioonid on vead, mis esinevad viiruse genoomis või geneetilises materjalis, kui see kordub. Enamik viirusi kogeb populatsiooni ringluses teatud variatsioone. SARS-CoV-2 puhul on paljud mutatsioonid ebaolulised või võivad isegi viirust nõrgendada. Teised võivad aga mõjutada viiruse edasikandumise hõlpsust ja isegi haiguse raskust.
"Kui paljud inimesed mõtlevad COVID-19-le, mõtlevad nad sellele ühele asjale, ainsusele," ütleb Gai. "Kuid see pole nii, nagu me seda vaatame. Viirusinfektsiooniga patsiendi keha viirus on segu paljudest selle viiruse koopiatest. "
Üks levinud mutatsioon, nimega D614G, põhjustab viiruse tippvalgus muutusi. Kuigi see ei olnud levinud, kui viirus hakkas selle aasta alguses kogu maailmas levima, on versioon sellest ajast alates kogu maailmas domineerinud. Autorid teatasid, et seda oli 99,3% nende kogutud pediaatrilistest proovidest.
D614G mutatsioon, mis suurendab viiruse poolt inimrakkudesse sisenemiseks kasutatavat valgu, võimaldab viirusel hõlpsamini edasi kanduda. Veel pole kindlaid tõendeid selle kohta, et see mutatsioon muudaks haiguse sümptomite raskust.
COVID-19 naastvalk vahendab koronaviiruse sisenemist peremeesrakku.
Uurimisrühm leidis siiski seose kladi 20C - viiruse muteerunud versiooni - ja raskemate sümptomite vahel. Kladid 20A, 20B ja 20C on kõik viiruse hiljuti muteeritud versioonid. Kõik selle uuringu rasked pediaatrilised juhtumid ja kõik, välja arvatud üks, mõõdukalt rasked juhtumid kandsid viiruse versiooni kladiga 20C.
Mutatsioonide tagajärjed
"Kui avalikkus sellist avaldust vaatab, kõlab hirmutavalt, et viirus on muteeruv," ütleb nakkushaiguste ekspert ja Johns Hopkinsi ülikooli meditsiiniprofessor MD, Stuart Campbell Ray Verywellile. "Kuid kõigil RNA viirustel on mutatsioonikiirus. Ja SARS-CoV-2 mutatsioonikiirus on umbes viis korda aeglasem kui gripp - vähemalt on see olnud siiani. "
See suhteliselt aeglane mutatsioonimäär võib olla kasulik teadlastele, kes üritavad uudse viirusega hakkama saada. Ray hoiatab, et kui nakatunud inimeste populatsioon suureneb, suureneb ka mutatsioonide kiirus.
Viirusnakkuse vastu immuunsüsteemi toetavate lahuste kasutuselevõtuga - nagu vaktsineerimine, eelnev kokkupuude viirusega, tervendav plasma ja antikehade ravi - võib SARS-CoV-2 areneda, et vältida immuunvastuseid. See tähendab, et on võimalik, et praegu paljulubavad vaktsiinikandidaadid võivad lähikuudel muutuda vähem efektiivseks, kuna viirus jätkab muteerumist.
"On oht - kuna see pandeemia on kontrolli alt väljas -, et need mutatsioonid võivad kuhjuda ja juhtuda võivad õiged, mis võivad immuunvastustest kõrvale hiilida," ütleb Ray, kes pole uuringuga seotud.
Vaktsiinid, mis on osutunud tõhusaks, kaitsevad organismi tõenäoliselt viiruse eest. Kuid nagu ka teiste laialt levinud viiruste, näiteks gripi puhul, võib tulevikus tekkivate uute viirusetüvede katmiseks vaja minna vaktsiini täiendavaid või uusi versioone.
Tundmatute muutujatega tegelemine
Kuigi teatatakse, et COVID-19 on lastel sageli vähem tõsine kui täiskasvanutel, lubatakse uuringu kohaselt üks kolmest haiguse tõttu hospitaliseeritud lapsest ICU-sse. Gai ütleb, et nende patsientide jaoks, kellel on raske haigus, võib viiruse geneetilise koostise mõistmine anda ravi arendamisel olulise ülevaate.
Sellegipoolest võib viiruse koostis ise nii palju öelda geneetikutele, kuidas see mõjutab nakatunud inimesi. Samuti peavad nad arvestama nakatunud isiku demograafiliste ja geneetiliste andmetega.
Gai hoiatab, et kuigi need leiud võivad viidata korrelatsioonile teatud mutatsioonide ja nende tulemuste vahel, on siiski vaja palju suuremaid uuringuid, et näidata, et mutatsioon põhjustab kindlasti raskemaid haigusi. Hoolimata sellest, et tegemist oli senise suurima genoomse pediaatrilise COVID-19 uuringuga, hõlmas see ainult 141 last.
"See ei ole tegelikult väga suur valimi suurus," ütleb Gai. "Me ei saa kuidagi teha haiguse fenotüübiga iga üksiku mutatsiooni korrelatsioonianalüüsi."
Lisaks ei võetud uuringus arvesse vanuse, soo, olemasolevate seisundite ja muude oluliste tegurite erinevusi. Patsientide proovide kogumise aja põhjal võib patsientide viiruskoormusega seotud järeldusi samuti moonutada. Sellegipoolest aitab uuring kaasa teadmiste kasvule selle kohta, kuidas geneetiline varieerumine võib olulisi tervisetulemusi kujundada.
"Me vajame selliseid aruandeid, et mõista, kuidas viirus areneb," ütleb Ray. "Selliste uuringute järjestustel, mis on kokku pandud kogu maailma järjestustega, on suur väärtus, aidates meil mõista, kuidas see viirus areneb ja kas peame selle haldamiseks oma strateegiaid kohandama."
.jpg)
